この質問の意味は2つのパターンがあります。パターンによって、最後の質問が持つ意味合いは違ってきます。
①今まで色々質問されたけど、本当にそれだけ？？
学生から、面接時に十分な質問がなかったときのパターンです。例えば、福利厚生や待遇、飲み会などの質問ばかりされ、業務に関する質問がまるでない学生に対し、時間がなくなってしまったので「最後に質問はありますか？」という場合です（よくあります）。
この場合、ダメそうに見える学生が、本当にダメなのか、実はまともなのかを確認しています。質問の内容以外の評価が高い学生は、時間がなかったり緊張しすぎて、本来聞くべき質問ができなかった可能性もあるので、最後に確認しているのです。対応によって結果が変わってきます。
②形式的に言っただけ
ほとんどがこっちのパターンです。「最後に確認したいことがあれば聞いてね？」というのは、学生に対する礼儀として普通に言うものなのです。
基本的には、最後の対応で結果が変わることはありません。その前に、落とすか上げるかは決まっています。この質問をされる前に、質問すべきことを参考に、質問すべきことは質問しておきましょう。
その上で「仮に御社に入社できる場合、学生時代にどのようなことをやっておくのが望ましいでしょうか？」や「聞きたかったことは十分伺えました。さらに御社に興味がわき、より志望が高まりましたので是非よろしくお願いいたします。ありがとうございました。」程度のあたりさわりのない質問や返答をしておけば十分です（あえて余計なことを聞いて評価を下げる必要はありません）。
結論
「聞くことを面接時間内にしっかり聞いておけば、対応は不要」ということです。最後の最後だけで結果がひっくり返ることは、現実には少ないのです。
次は、言っていることはマトモでも落ちる学生の特徴です（面接で評価が下がる5つの特徴）。